Tokio, 2039. Han pasado 10 años desde que el virus Navidad Perdida azotó el país. Desde entonces, Japón está controlado por la organización mundial GHQ. Ouma Shu es un muchacho bastante cobarde que no lleva bien relacionarse con los demás. Sin embargo, su vida dará un giro de 180º al conocer a Yuzuriha Inori, uno de los miembros del grupo de la resistencia conocido como la Funeraria, y tras adquirir el Genoma Nulo, que le permitirá usar los genomas de las personas que le rodean para codificar su ADN en armas y otros útiles. ¿Decidirá Shu luchar del lado de la Funeraria o huirá, como siempre ha hecho?